Please use this identifier to cite or link to this item:
https://olympias.lib.uoi.gr/jspui/handle/123456789/39943| Title: | Ανίχνευση στελεχών του ιού SARS-CoV-2 με μοριακές μεθόδους Detection and Identification of SARS-CoV-2 Strains Using Molecular Methods |
| Institution and School/Department of submitter: | Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας, Τμήμα Ιατρικής |
| Subject classification: | Ιατρική Μικροβιολογία |
| Keywords: | Πανδημία,Γεννετική ανάλυση,Κορονοιός,Sars CoV-2,NGS,PCR |
| URI: | https://olympias.lib.uoi.gr/jspui/handle/123456789/39943 |
| Table of contents: | ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ Εισαγωγή ........................................................................................................................ 9 1. Πανδημία COVID-19 .......................................................................................................................9 2. Ιός MERS ......................................................................................................................................... 10 3. Ιοί SARS ........................................................................................................... 11 3.1. SARS-CoV .......................................................................................................... 11 3.2. SARS-CoV-2 ...................................................................................................... 13 3.2.1. Επιδημιολογία, Μετάδοση του ιού και Κλινική σημειολογία της COVID-19 ...... 13 3.2.2. Περιγραφή της δομής και του γονιδιώματος του SARS-CoV-2 ....................... 18 4. Μεταλλάξεις SARS CoV-2 ................................................................................... 25 1. Μετάλλαξη Alpha ....................................................................................... 26 2. Μετάλλαξη Beta ........................................................................................ 27 3. Μετάλλαξη Gamma ................................................................................... 27 4. Μετάλλαξη Delta ........................................................................................ 28 5. Μετάλλαξη Omicron ................................................................................... 29 5. Μοριακές μέθοδοι ανίχνευσης του ιού SARS-CoV-2 και των μεταλλάξεων ........ 31 5.1. Συλλογή Δειγμάτων για την ανίχνευση του ιού SARS-CoV-2 ............................. 31 5.2. Μοριακές μέθοδοι ανίχνευσης ....................................................................... 34 5.2.1. PCR Πραγματικού Χρόνου, real time RT-PCR ............................................. 34 5.2.1.1. Σφάλματα της μεθόδου RT-PCR .............................................................. 44 5.2.2. Ψηφιακή PCR -Digital PCR (dPCR) ............................................................. 46 5.2.3. CRISPR-Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats ........... 48 5.2.4. LAMP-Loop mediated isothermal amplification ............................................ 52 5.2.5. Mέθοδος ARMS (Amplification Refractory Mutation System-Σύστημα Ενίσχυσης Ανθεκτικό στις Μεταλλάξεις) ................................................... 58 5.2.6. Αλληλούχιση επόμενης γενιάς - Next Generation Sequencing (NGS) .............. 62 5.2.6.1. Αλληλούχιση NGS μέσω σύνθεσης .......................................................... 70 5.2.6.2. Αλληλούχιση με Nanopores .................................................................... 72 6. Συζήτηση – Συμπεράσματα ................................................................................ 76 7. Περίληψη ............................................................................................................ 80 8. Abstract ............................................................................................................... 81 9. Βιβλιογραφία ....................................................................................................... 82 10.Ιστότοποι ....…………………………………………………………………………….97 11.Κατάλογος Πινάκων / Εικόνων ........................................................................... 98 12.Χρήσιμες Συντομογραφίες ................................................................................ 101 |
| Appears in Collections: | Διατριβές Μεταπτυχιακής Έρευνας (Masters) - ΙΑΤ |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| Μ.Ε. ΡΕΤΣΑΣ ΙΠΠΟΚΡΑΤΗΣ 2026.pdf | 2.8 MB | Adobe PDF | View/Open |
This item is licensed under a Creative Commons License