Please use this identifier to cite or link to this item:
https://olympias.lib.uoi.gr/jspui/handle/123456789/36836Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | Triantopoulou, Evangelia | en |
| dc.contributor.author | Τριαντοπούλου, Ευαγγελία | el |
| dc.date.accessioned | 2024-02-29T07:52:20Z | - |
| dc.date.available | 2024-02-29T07:52:20Z | - |
| dc.identifier.uri | https://olympias.lib.uoi.gr/jspui/handle/123456789/36836 | - |
| dc.identifier.uri | http://dx.doi.org/10.26268/heal.uoi.16549 | - |
| dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States | * |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/ | * |
| dc.subject | Nuclear envelope | en |
| dc.subject | Nuclear lamina | en |
| dc.subject | Chromatin | en |
| dc.subject | Lamins | en |
| dc.subject | Lamin B receptor | en |
| dc.subject | Πυρηνικός φάκελος | el |
| dc.subject | Πυρηνική λάμινα | el |
| dc.subject | Χρωματίνη | el |
| dc.subject | Λαμίνες | el |
| dc.subject | Υποδοχέας της λαμίνης Β | el |
| dc.title | The role of nuclear lamina and nuclear envelope proteins in chromatin architecture | en |
| dc.title | Ο ρόλος της πυρηνικής λάμινας και των πρωτεϊνών του πυρηνικού φακέλου στην αρχιτεκτονική της χρωματίνης | el |
| dc.type | masterThesis | en |
| heal.type | masterThesis | el |
| heal.type.en | Master thesis | en |
| heal.type.el | Μεταπτυχιακή εργασία | el |
| heal.dateAvailable | 2024-02-29T07:53:20Z | - |
| heal.language | en | el |
| heal.access | free | el |
| heal.recordProvider | Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας | el |
| heal.publicationDate | 2023-09 | - |
| heal.abstract | he nucleus is a unique feature of eukaryotic cells inside which the genetic material is stored in the form of chromatin. During the past few decades, the development of advanced methods, such as Chromosome Conformation Capture (3C) technologies, and high-resolution microscopic techniques has revealed that the non- stochastic organization of chromatin in the nuclear interior is regulated by multiple mechanisms and factors, that act in an orchestrated manner in order to maintain nuclear integrity and chromatin architecture. The multiple levels of chromatin organization include, among others, distinct chromosome positions, called chromosome territories, loop formation followed by long-range inter- and intrachromosomal interactions (Topologically Associated Domains, TADs), as well as interactions of chromatin domains with other nuclear features, such as the Nuclear Lamina (Lamina Associated Domains, LADs) and the nucleoli (Nucleoli Associated Domains, NADs). The microenvironment of the nuclear periphery and the nuclear envelope have been extensively studied and have been found to play a key role in the establishment of the chromatin landscape and the regulation of gene expression. Conventionally, the nuclear periphery serves as a binding platform for chromatin domains of heterochromatic nature, while heterochromatin can also be found on the surface of nucleoli or in distinct foci inside the nucleoplasm. On the other hand, euchromatin is found to be dispersed in the rest of the nucleoplasm and near the openings of the nuclear pores. The inspection of cell types, such as the rod cells of the retina of nocturnal mammals, which exhibit an inversion of the conventional chromatin architecture, revealed two major tethers of the nuclear periphery that maintain heterochromatin’s peripheral positioning: the A-tether, which consists of Lamin A/C and its interacting proteins, and the B-tether, which corresponds to LBR. This work aimed to investigate the role LBR and Lamin A/C might play in the maintenance of nuclear integrity and chromatin architecture, using NIH/3T3 mouse fibroblasts that had been knocked out for these two key components of the nuclear periphery, either individually or in combination. More specifically, the nuclear envelope properties and chromatin dynamics were investigated using mostly microscopic methods. The results obtained so far indicated that the concurrent absence of these two proteins can cause asymmetric localization of major components of the nuclear periphery and alterations in the distribution of chromatin inside the nucleus, yet, without affecting chromatin dynamics, or other cellular functions, such as cell motility. On the other hand, single (LBR or Lamin A/C) knockout cells appeared to be only mildly affected by the absence of one of these proteins. Despite these nuclear aberrations, all mutant cell populations were able to survive and proliferate. These observations implied the existence of other mechanisms that may have a compensatory effect and make up for the absence of LBR and Lamin A/C. However, there are still several questions that need to be clarified in order to gain better insight into the causal relationship between the lack of these two proteins and the phenotypes generated, as well as the principles that rule chromatin architecture in general. | en |
| heal.abstract | Ο πυρήνας αποτελεί ένα μοναδικό χαρακτηριστικό των ευκαρυωτικών κυττάρων μέσα στο οποίο αποθηκεύεται το γενετικό υλικό με τη μορφή της χρωματίνης. Τις τελευταίες δεκαετίες, η ανάπτυξη προηγμένων μεθόδων, όπως οι Chromosome Conformation Capture (3C) τεχνολογίες, και οι τεχνικές μικροσκοπίας υψηλής ανάλυσης, έχουν αποκαλύψει ότι η μη στοχαστική οργάνωση της χρωματίνης στο εσωτερικό του πυρήνα ρυθμίζεται από πολλαπλούς μηχανισμούς και παράγοντες που δρουν συγχρονισμένα για τη διατήρηση της ακεραιότητας του πυρήνα και της αρχιτεκτονικής της χρωματίνης. Τα πολλαπλά επίπεδα οργάνωσης της χρωματίνης περιλαμβάνουν, μεταξύ άλλων, την κατάληψη διακριτών θέσεων στον πυρήνα από τα χρωμοσώματα, που ονομάζονται χρωμοσωμικές επικράτειες, σχηματισμούς βρόχων που ακολουθούνται από μεγάλης εμβέλειας δια- και ενδοχρωμοσωμικές αλληλεπιδράσεις (Τοπολογικά Διασυνδεδεμένες Επικράτειες – TADs), καθώς και αλληλεπιδράσεις τμημάτων της χρωματίνης με άλλες δομές του πυρήνα, όπως η πυρηνική λάμινα (Διασυνδεδεμένες με τη Λάμινα Επικράτειες – LADs) και οι πυρηνίσκοι (Διασυνδεδεμένες με τους Πυρηνίσκους Επικράτειες – NADs). Το μικροπεριβάλλον της πυρηνικής περιφέρειας και ο πυρηνικός φάκελος έχουν μελετηθεί εκτενώς και έχει βρεθεί ότι διαδραματίζουν βασικό ρόλο στον καθορισμό του χρωματινικού τοπίου και στη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης. Συμβατικά, η πυρηνική περιφέρεια χρησιμεύει ως πλατφόρμα δέσμευσης για περιοχές της χρωματίνης ετεροχρωματινικής φύσεως, ενώ η ετεροχρωματίνη μπορεί επίσης να βρεθεί στην επιφάνεια των πυρηνίσκων ή σε διακριτές εστίες μέσα στο νουκλεόπλασμα. Από την άλλη πλευρά, η ευχρωματίνη βρίσκεται διασκορπισμένη στο υπόλοιπο νουκλεόπλασμα και κοντά στα ανοίγματα των πυρηνικών πόρων. Η διερεύνηση κυτταρικών τύπων, όπως τα ραβδία του αμφιβληστροειδούς των νυκτόβιων θηλαστικών, που παρουσιάζουν αντιστροφή της συμβατικής αρχιτεκτονικής της χρωματίνης, αποκάλυψε δύο κύριους μηχανισμούς πρόσδεσης στην πυρηνική περιφέρεια που διατηρούν την περιφερειακή τοποθέτηση της ετεροχρωματίνης: τον A- tether, ο οποίος αποτελείται από την Lamin A/C και τις πρωτεΐνες που αλληλεπιδρούν με αυτήν, και τον B-tether, που αντιστοιχεί στον LBR. Η παρούσα εργασία στόχευε στη διερεύνηση του ρόλου που ενδέχεται να διαδραματίζουν ο LBR και η Lamin A/C στη διατήρηση της ακεραιότητας του πυρήνα και της αρχιτεκτονικής της χρωματίνης, με τη χρήση NIH/3T3 ινοβλαστών ποντικού στους οποίους είχε γίνει απαλοιφή των δύο αυτών βασικών συστατικών της πυρηνικής περιφέρειας, είτε μεμονωμένα είτε συνδυαστικά. Πιο συγκεκριμένα, διερευνήθηκαν οι ιδιότητες του πυρηνικού φακέλου και η δυναμική της χρωματίνης χρησιμοποιώντας κυρίως μεθόδους μικροσκοπίας. Τα αποτελέσματα που έχουν προκύψει έως τώρα έδειξαν ότι η ταυτόχρονη απουσία αυτών των δύο πρωτεϊνών μπορεί να προκαλέσει την ασύμμετρη κατανομή κύριων συστατικών της πυρηνικής περιφέρειας, αλλά και αλλαγές στην κατανομή της χρωματίνης στο εσωτερικό του πυρήνα, χωρίς ωστόσο να επηρεάζεται η δυναμική της χρωματίνης ή άλλες κυτταρικές λειτουργίες, όπως η κινητικότητα των κυττάρων. Από την άλλη πλευρά, τα κύτταρα που είχαν υποστεί μεμονωμένη απαλοιφή μιας εκ των δύο πρωτεϊνών (LBR ή Lamin A/C) φάνηκαν να επηρεάζονται μόνο ελαφρώς. Παρά τις εν λόγω ατυπίες, όλοι οι πληθυσμοί κυττάρων που είχαν υποστεί κάποια μετάλλαξη αποδείχθηκαν ικανοί στο να επιβιώνουν και να πολλαπλασιάζονται. Αυτές οι παρατηρήσεις υποδηλώνουν την ύπαρξη άλλων μηχανισμών που μπορεί να έχουν αντισταθμιστικό αποτέλεσμα και να αναπληρώνουν την απουσία των LBR και Lamin A/C. Ωστόσο, υπάρχουν ακόμη πολλά ερωτήματα που πρέπει να διευκρινιστούν προκειμένου να αποκτήσουμε μία καλύτερη εικόνα της αιτιώδους σχέσης μεταξύ της έλλειψης αυτών των δύο πρωτεϊνών και των φαινοτύπων που προκύπτουν, καθώς και των αρχών που διέπουν την αρχιτεκτονική της χρωματίνης σε γενικότερο πλαίσιο. | el |
| heal.advisorName | Πολίτου, Αναστασία | el |
| heal.committeeMemberName | Πολίτου, Αναστασία | el |
| heal.committeeMemberName | Γεωργάτος, Σπυρίδων | el |
| heal.committeeMemberName | Φριλίγγος, Ευστάθιος | el |
| heal.committeeMemberName | Παπαμαρκάκη, Θωμαϊς | el |
| heal.committeeMemberName | Λιακόπουλος, Δημήτριος | el |
| heal.academicPublisher | Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικής | el |
| heal.academicPublisherID | uoi | el |
| heal.numberOfPages | 157 σ. | el |
| heal.fullTextAvailability | true | - |
| Appears in Collections: | Διατριβές Μεταπτυχιακής Έρευνας (Masters) - ΙΑΤ | |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| Μ.Ε. Τριαντοπούλου Ευαγγελία (2023).pdf | 9.48 MB | Adobe PDF | View/Open |
This item is licensed under a Creative Commons License
