Please use this identifier to cite or link to this item:
https://olympias.lib.uoi.gr/jspui/handle/123456789/32320Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | Σάρρας, Αλέξανδρος | el |
| dc.contributor.author | Sarras, Alexandros | en |
| dc.date.accessioned | 2023-02-03T12:09:41Z | - |
| dc.date.available | 2023-02-03T12:09:41Z | - |
| dc.identifier.uri | https://olympias.lib.uoi.gr/jspui/handle/123456789/32320 | - |
| dc.identifier.uri | http://dx.doi.org/10.26268/heal.uoi.12131 | - |
| dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States | * |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | * |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/ | * |
| dc.subject | Καρκίνος του πνεύμονα | el |
| dc.subject | Μεταγραφικοί παράγοντες | el |
| dc.subject | Καρκινικοί αναστολείς | el |
| dc.subject | Micro RNA | en |
| dc.subject | NF-nB | en |
| dc.subject | Lung cancer | en |
| dc.title | Διερεύνηση της σχέσης και του ρόλου του NF-κΒ και του miR-342 στον καρκίνο του πνεύμονα | el |
| dc.title | Investigating the relationship and role of NF-κB and miR-342 in lung cancer | en |
| dc.type | masterThesis | * |
| heal.type | masterThesis | - |
| heal.type.en | Master thesis | en |
| heal.type.el | Μεταπτυχιακή εργασία | el |
| heal.classification | Πεύμονας -- Καρκίνος | - |
| heal.dateAvailable | 2023-02-03T12:10:41Z | - |
| heal.language | el | - |
| heal.access | free | - |
| heal.recordProvider | Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας | el |
| heal.publicationDate | 2022 | - |
| heal.abstract | Ο μεταγραφικός παράγοντας NF-κΒ έχει συνδεθεί με πληθώρα βιολογικών διεργασιών και ασθενειών, μεταξύ των οποίων και ο καρκίνος. Η εμπλοκή των μελών της υπεροικογένειας των μεταγραφικών παραγόντων NF-κΒ στον καρκίνο δεν περιορίζεται μόνο στον ρόλο που διαδραματίζει ως μεσολαβητής των ανοσολογικών αποκρίσεων του κυττάρου, αλλά συμβάλει επίσης στη ρύθμιση του κυτταρικού πολλαπλασιασμού, της απόπτωσης, της κυτταρικής επιβίωσης αλλά και της απόκρισης στις διάφορες μορφές στρες. Παράλληλα, τα microRNA (miRNA, miR), τα οποία αποτελούν μικρά μη κωδικά μόρια RNA που παρουσιάζουν ρυθμιστική δράση, μπορούν είτε να καταστείλουν, είτε να προάγουν την ανάπτυξη του όγκου μέσω της μειορρύθμισης ενός ευρέος φάσματος γονιδίων-στόχων. Η έρευνα γύρω από αυτά μπορεί να οδηγήσει στην ταυτοποίηση νέων προγνωστικών βιοδεικτών αλλά και πιθανών θεραπευτικών στόχων. Σκοπός της παρούσας μελέτης είναι (α) η ταυτοποίηση ΙΚΚβ/NF-κB-ρυθμιζόμενων miRNA που συμμετέχουν σε ρυθμιστικούς μηχανισμούς του NF-κB στο μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα υπό την επίδραση γονοτοξικού στρες, και (β) η διερεύνηση του πιθανού μηχανισμού δράσης των ταυτοποιημένων miRNA μέσω εύρεσης γονιδίων στόχων τους. Για να ταυτοποιηθούν τα miRNA που υφίστανται ρύθμιση από την κανονική σηματοδοτική πορεία του NF-κΒ, η κινάση ενεργοποίησης του NF-κΒ, ΙΚΚβ (ΙΚΚβKD), μειορρυθμίστηκε (knock-down, KD) με τη χρήση ενός ρετροϊικού φορέα. Δύο διαφορετικές κυτταρικές σειρές μη μικροκυτταρικού καρκίνου του πνεύμονα, Α549 και Η1437, με διαφορετικό γενετικό υπόβαθρο, μελετήθηκαν υπό την επίδραση του χημειοθεραπευτικού φαρμάκου ετοποσιδίου (VP16). Οι τροποποιημένες κυτταρικές σειρές Α549 επιλέχθηκαν για την ταυτοποίηση miRNA που ρυθμίζονται από την κινάση σερίνης/θρεονίνης ΙΚΚβ. Η ανάλυση των miRNA με την τεχνολογία Nanostring που ελέγχει τα επίπεδα τους στα κύτταρα Α549-ΙΚΚβKD και στα αντίστοιχα κύτταρα ελέγχου, είτε παρουσία είτε απουσία ετοποσιδίου, κατέδειξε μια σειρά από miRNA, τα επίπεδα των οποίων επηρεάστηκαν από τηn αποσιώπηση της ΙΚΚβ. Ένα από αυτά, το miR-342-3p, εμφάνισε τη μεγαλύτερη αύξηση, και μελετήθηκε ο ρόλος του στην καρκινογένεση καθώς επίσης και οι πιθανοί του στόχοι. Η υπερέκφραση του miR-342-3p σε κύτταρα Α549 και Η1437 είχε σαν αποτέλεσμα την ανάπτυξη σημαντικά μικρότερων όγκων που αναπτύχθηκαν ως σε ξενομοσχεύματα in vivo σε ανοσοκατεσταλμένα ποντίκια NSG, καταδεικνύοντας τον ογκοκατασταλτικό του ρόλο στον καρκίνο του πνεύμονα. Προκειμένου να μελετηθεί ο ογκοκατασταλτικός μηχανισμός δράσης του miR-342-3p, πραγματοποιήθηκε εκτεταμένη βιοπληροφορική ανάλυση για την εύρεση πιθανών στόχων του miR-342-3p. Η ανάλυση κατέδειξε ότι στοχεύει, κυρίως, γονίδια με ογκογόνο δράση όπως το γονίδιο KDM6B (JMJD3). Το γονίδιο KDM6B (JMJD3) κωδικοποιεί την απομεθυλάση της λυσίνης των Η3 ιστονών 6Β η οποία καταλύει την αφαίρεση της τριμεθυλίωσης στη λυσίνη 27 της ιστόνης Η3 (H3K27 trimethylation), μιας κατασταλτικής επιγενετικής τροποποίησης της χρωματίνης, η οποία εμπλέκεται στην αναδιοργάνωση της χρωματίνης και στην αποσιώπηση της γονιδιακής έκφρασης. Στην παρούσα μελέτη, επαληθεύτηκε πειραματικά με qPCR η μειορρύθμιση του KDM6B σε κύτταρα Α549 και Η1437 που υπερεκφράζανε το miR-342-3p. Συμπερασματικά, η ΙΚΚβ προάγει την καρκινογένεση του πνεύμονα μειορρυθμίζοντας την έκφραση του ογκοκατασταλτικού miR-342-3p το οποίο στοχεύει τον επιγενετικό ρυθμιστή KDM6B (JMJD3) διατηρώντας τη χρωματίνη σε ανοικτή ενεργή μορφή και κατά προάγει την έκφραση γονιδίων που πιθανά εμπλέκονται στην καρκινογένεση του πνεύμονα. | el |
| heal.abstract | The NF-κΒ transcription factors (TFs) have been associated with a variety of biological functions and pathological conditions, including cancer. The contribution of the NF-κΒ transcription factor superfamily members in cancer is not limited to its function as a mediator in inflammatory and immune responses, but it is also involved in the regulation of cell proliferation, apoptosis, cell survival and stress responses. NF-κB TFs is involved in these processes by regulating both protein-coding genes and non-coding genes such as microRNAs (miRNAs). MiRNAs are small non-coding RNA molecules that have regulatory activity, and can either suppress or induce cancer cell growth by downregulating a range of target genes. Research around them can help discover predictive biomarkers and potential therapeutic targets. The purpose of the present study is to identify (a) IKKβ/NF-κB-regulated miRΝΑs that are involved in in non-small cell lung cancer (NSCLC) development, and (b) potential targets of the identified IKKβ-regulated miRNAs that may play a role in NSCLC development. To identify miRNAs that are regulated by the canonical NF-κΒ signalling pathway, the upstream canonical NF-κB activating serine-/threonine (Ser/Thr) kinase, IKKβ, was downregulated using retroviral vectors in human NSCLC cell lines. Two different NSCLC cell lines, A549 and H1437 with different genetic backgrounds, were used to knock-down IKKβ (IKKβ KD) and investigate the differential expression of miRNAs in IKKβ KD and vector control cells under treatment with the chemotherapeutic agent etoposide (VP16). The A549 cell line was used to identify miRNAs with altered expression in IKKβKD cells. Using miRNA Nanostring technology, miRNA levels were analysed in the A549 -IKKβKD cell line and the corresponding control cell line, either in the presence or absence of VP16. One of the identified miRNAs, miR-342-3p, exhibited the highest expression levels in the A549 - IKKβKD cells and it was further analysed to investigate its role in NSCLC development and its potential mechanism of action by identifying potential targets using extensive bioinformatics analysis. To study the in vivo role of miR-342-3p in NSCLC development, two different human NSCLC cancer cell lines A549 and H1437 were generated by overexpressing miR-342-3p. Vector control and miR-342-3p-expressing cells were subcutaneously inoculated in either side of immune-compromised NSG mice and allowed to grow as in vivo xenografts for three weeks. The results showed that miR-342-3p suppressed human NSCLC growth in vivo xenografts in NSG mice, therefore acted as a tumor suppressor. To study the mechanism of the tumour suppressive action of miR-342-3p in lung cancer, an extensive bioinformatics analysis was performed in an attempt to identify potential miR 342-3p targets. Amongst the targets identified, mainly oncogenic molecules, was the KDM6B (JMJD3) gene, which encodes the histone lysine demethylase 6B. This enzyme specifically demethylates di- or tri-methylated lysine 27 of histone H3 (H3K27me2 or H3K27me3). H3K27 trimethylation is a repressive epigenetic mark controlling chromatin organisation and gene silencing. The downregulation of KDM6B by miR-342-3p was experimentally verified by qPCR in the human NSCLC cells, A549 and H1437 overexpressing miR-342-3p. In conclusion, IKKβ promotes lung carcinogenesis by downregulating the expression of the tumor suppressor miR-342-3p which targets the epigenetic regulator KDM6B (JMJD3) maintaining the chromatin in an open active form promoting the expression of genes that likely involved in human non-small cell cancer development. | en |
| heal.advisorName | Κωλέττας, Ευάγγελος | el |
| heal.committeeMemberName | Κωλέττας, Ευάγγελος | el |
| heal.committeeMemberName | Σύρρου, Μαρίκα | el |
| heal.committeeMemberName | Κούκλης, Παναγιώτης | el |
| heal.academicPublisher | Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικής | el |
| heal.academicPublisherID | uoi | - |
| heal.numberOfPages | 74 σ. | - |
| heal.fullTextAvailability | true | - |
| Appears in Collections: | Διατριβές Μεταπτυχιακής Έρευνας (Masters) - ΙΑΤ | |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| Μ.Ε. ΣΑΡΡΑΣ ΑΛΕΞΑΝΔΡΟΣ 2022.pdf | 1.96 MB | Adobe PDF | View/Open |
This item is licensed under a Creative Commons License
